柏辰生活

Bio-Chain Life

讨论:关于《Nature》对Western Blot图片的要求


《Nature》期刊是允许对Blots图片进行剪切的,但是剪切必须要在图注中进行说明,同时《Nature》也提到了一些期刊要求必须在文章增补信息中提供完整的blots图片。裁剪后的Blots图必须有一定的宽度“上下各6个条带的宽度”(不要过窄,以掩盖一些必要信息)。高对比度的blots图片是不允许的,因为这会掩盖一些附加条带信息。投稿者应尽量曝光出带有灰色背景的图片,若高对比度blots不可避免,也应在增补信息中提供多次曝光的图片(以说明没有掩盖其他信息)。

 

 

什么是高对比度blots图片?我们来看一下其他期刊高对比度blots的示例:

 

(Journal of Cell Science,Best Practices: gels, blots and images in JCS figures)

 

(Journal of Biological Chemistry, Good practices for preparing publication-quality figures)

 

(The Journal of Experimental Medicine,Gel Image Guide 2016)

 


对于灰度图像,每个象素用一个字节(8bit)表示,一幅图像可以有256级灰度;若每个象素用两个字节(16bit)表示,一幅图像可以有65536级灰度。为了保留更多实验细节,16bit 的TIF图像更为常见。所以,千万不要以为某些8bit数据能给您带来更好的结果体验(背景干净,条带清晰),它也许会给您带来文章被拒的风险!Journal of Cell Science已经明确表示,这样的文章有可能会因此被拒收。

 

 

我们一起来“学习”一下8bit的blot数据,看看问题出在哪里。这是一幅用ImageJ软件打开的8bit化学发光图,几乎没有背景信息(属于高对比度类型,需要调整对比度,以显示灰色背景)。

 

 

当我们调整对比度以后会发现依然有很多背景信息丢失,而且图片颗粒感很强!图片质量很差!根本无法显示成像对象的细节信息!

 

 

真正的16bit数据在调整对比度后,可以显示出均一、细腻的灰色背景。我们可以发现,这原来是在96孔板上的化学发光信号(将二抗比例稀释后,加入ECL底物)。但在8bit的TIF图片上,根本无法显示出这样的背景信息。特别是按照《Nature》要求调整出来的背景后,图片质量无法令人满意,文章有可能会被拒绝发表!