Agena 新品发布：VeriDose™CYP2D6 CNV Panel，挑战Hybrid allele，精准检测拷贝数

一、CYP2D6简介

CYP2D6是细胞色素P450家族中的非常重要的药物代谢酶之一，它仅占肝脏酶总量的2％~9％，却参与20％～30％临床上常见药物的代谢，包括抗抑郁药、抗心律失常药、抗精神病药、镇痛药、癌症治疗药物等。CYP2D6是最先被发现具有基因多态性的药物基因组学基因，CYP2D6的基因多态性可引起酶活性和数量的差异，从而导致药物代谢个体差异的产生。根据药物代谢能力的不同，人群中的CYP2D6的代谢表型可分为超快代谢型(UMs)、快代谢型(EMs)、中等代谢型(IMs)、慢代谢型(PMs)。

二、CYP2D6拷贝数检测的临床意义

目前已经发现100多种变异位点，包括单核苷酸（SNP）变异和拷贝数变异（CNV），虽然CYP2D6基因CNV发生率很低，大约仅占所有变异的10%，但其引起的临床效应不容忽视，多拷贝基因的携带者会更快速地代谢药物，使常规药物剂量不能达到治疗效果，低拷贝基因的携带者代谢能力很弱，药物活性代谢产物少，疗效差，且发生毒性的风险大，因此，CYP2D6CNV检测也是药物基因组学领域非常重要的一个方面，准确鉴定CYP2D6的拷贝数对于对指导临床合理用药和个体化用药具有重要的意义。

三、CYP2D6CNV检测面临的挑战

CYPD存在于第22号染色体上，由CYP2D6、CYP2D7P、CYP2D8P组成，其中CYP2D7P是假基因，只有CYP2D6能够在肝脏及其他组织中表达，编码表达酶活性蛋白，发挥代谢作用。由于假基因的存在，通过基因重组现象，CYP2D6会与CYP2D7，CYP2D8等假基因发生遗传物质的交换形成杂交型等位基因（Hybridallele）。根据不同种族基因组特征，根据种族差异，多达45%的普通人群具有某种杂交的等位基因，从而引起基因失去功能，主要包括*36，*13和*68.

图1：常见的3种 Hybrid Allele

目前常用的CYP2D6CNV检测方法（如LongRangePCR技术及目前商业化的基于qPCR技术的检测产品）无法将这些功能缺陷杂交型等位基因（Hybridalleles）及其它CYP2D6等位基因型分开，在杂交型等位基因存在的情况下，难以实现准确CYP2D6CNV分型，从而引起对患者药物代谢率的错误评估，直接影响用药方案的选择和毒性风险评估。

四、VeriDoseTMCYP2D6CNVpanel精确鉴定拷贝数

Agena公司近期隆重推出CYP2D6CNV检测新产品——VeriDose™CYP2D6CNVpanel，针对CYP2D6基因的6个不同区域设计了11种检测，在单个反应内完成所有11种检测，实现即使在那些Hybridalleles存在的情况下，对CYP2D6拷贝数进行精确检测，提供准确的分型结果。

图2：Agena 检测*13 CYP2D7-CYP2D6 Hybrid Allele的图示

目前所采用的其它CYP2D6CNV检测产品，仅针对Exon9或/和Intron6两个位置设计检测位点，如图4所示，无法区分CYP2D6Hybridallele，出现结果判读错误的现象。

图3：其它技术检测位点的设计

该患者存在*13型Hybridallele，仅针对Exon9设计检测的技术无法区分该等位基因与*1型等位基因，PCR的判读结果：*1x2,*13N，拷贝数为3，患者为超快代谢型，事实上，患者的CYP2D6准确的分型为*1/*1,*13，为正常代谢型因此，如果以超快代谢型的标准为正常代谢型患者用药的话，将会大大提高药物毒性风险。