上海柏辰生物科技有限公司
 

技术服务部

Technical Service Department

首页 >> 技术服务部 >> 服务平台 >> 数字PCR技术服务介绍

数字PCR技术服务介绍

上海柏辰生物数字PCR技术服务——真正的高灵敏度微滴式数字PCR


QX200™ Droplet Digital™ PCR系统


　　微滴式数字PCR——Bio-Rad公司的QX200 PCR系统是能够直接精准记录DNA分子个数的第三代PCR。其原理是将含有核酸分子的反应体系分成上万个微滴，每个微滴都是一个独立的PCR反应体系，PCR反应后对每个微滴的荧光信号进行检测，最终用专用分析软件计算出待检测样品的绝对定量值。



服务项目

液态活检——游离DNA检测拷贝数变异分析稀有突变检测二代测序结果的精准验证

低丰度病原微生物检测转基因成分鉴定分析

微小差异基因或单细胞基因表达分析



技术优势

● 痕量检出

单分子水平扩增，微量DNA荧光信号不再被覆盖。

● 绝对定量

直接提供浓度值（copeis/ul），不依赖扩增曲线、标准品。

● 高灵敏度

灵敏度高达0.001%。

● 高精确度

终点读取荧光信号，可区分1.1倍差异。

● 高稳定性

受抑制剂影响很小，CV值小于5%。


上海柏辰已发表部分文章展示

突变检测

Guo QM, Wang L, Yu WJ, Qiao LH, Zhao MN, Hu XM, Sun YM, Ni S, Xu YH, Lou JT. Detection of Plasma EGFR Mutations in NSCLC Patients with a Validated ddPCR Lung cfDNA Assay [J]. J Cancer, 2019, 10(18):4341-4349.

◆ 建立肺癌靶向用药伴随诊断检测体系。

◆ 体系灵敏度低至0.1%。


定量检测

Xunhua Zhu, Pengcheng Liu , Lijuan Lu , Huaqing Zhong , Menghua Xu , Ran Jia , Liyun Su , Lingfeng Cao , Yameng Sun , Meijun Guo , Jianyue Sun , Jin Xu. Development of a multiplex droplet digital PCR assay for detection of enterovirus, parechovirus, herpes simplex virus 1 and 2 simultaneously for diagnosis of viral CNS infections [J]. Virol J, 2022, 19(1):70.

◆ 脑脊液样本中痕量拷贝病原感染检测。

◆ 建立数字PCR四重检测体系。


基因

检测内容

临床诊断

AR-V7

ar-v7剪切变异表达

前列腺癌

EGFR

19del（57种）、L858R、T790M、L861Q、G719S、S768I、G719X

肺癌等

20ins【V769_D770insASV、D770_N771insG、H773_V774insNPH、N771_H773dup、D770_N771insSVD、S768_D770dup、A763_Y764insFQEA、H773_V774insH】

T790M-C797S顺反式

ALK

EML4-ALK(cDNA)：E13A20

肺癌等

EML4-ALK(cDNA)：E20A20

EML4-ALK(cDNA)：E6A20

BRAF

V600E

黑色素瘤等

ERBB2（HER2）

CNV

乳腺癌、胃癌等

KRAS

G12D、G12A、G12V、G12C、G12R、G12S、G13D、Q61H、Q61L等

肺癌、大肠癌等

MET

CNV

肺癌等

PIK3CA

E545K、E542K、H1047R等

乳腺癌、卵巢癌等

其余可检测易感基因（液态活检）：AKT1、ATM、BRCA1、BRCA2、CCDC6-RET融合、C-KIT、CD74-ROS1、CHEK1、EML4-ALK融合、ERBB2、FGFR3、FRY、IDH1、MET、NRAS、PALB2、PDGFRA、RAD51C、RAD54L、SLC34A2(E4)-ROS1(E32)、TP53TPM3-NTRK1融合等相关突变位点。