技术服务部

Technical Service Department

纳米孔测序服务介绍

Nanopore三代测序——能够实现核酸分子长读长测序



纳米孔测序系统


  Nanopore三代测序是新一代基于蛋白纳米孔的单分子长度长测序技术。当DNA/RNA链以稳定的速度通过镶嵌在电阻膜的蛋白纳米孔时,不同碱基引发电流波动产生特征性改变,进而被特异性识别,用以确定DNA/RNA的碱基序列。



测序原理图


应用方向

基因组拼接

全长转录组

大片段结构变异

物种鉴定


技术优势

● 长度长

Reads可达Mb,能够完美跨越高重复区域和高复杂区域,便于分析。

● 直接测序

直接测序原始DNA和RNA,不需要进行PCR扩增,避免了扩增偏好性;保留了原始碱基修饰信息。

● 实时

快速知晓样本状态,完成种属鉴定。


上海柏辰已发表部分文章展示

耐药突变测序

Zhao K, Tu C, Chen W, Liang H, Zhang W, Wang Y, Jin Y, Hu J, Sun Y, Xu J, Yu Y. Rapid Identification of Drug-Resistant Tuberculosis Genes Using Direct PCR Amplification and Oxford Nanopore Technology Sequencing [J]. Can J Infect Dis Med Microbiol, 2022, 2022:7588033.

◆ 突变检出与一代测序相比完全一致,涵盖更多区域。

◆ 与传统药敏试验相比,提前3-4周可获知患者耐药情况。