Nanopore三代测序——能够实现核酸分子长读长测序
纳米孔测序系统
Nanopore三代测序是新一代基于蛋白纳米孔的单分子长度长测序技术。当DNA/RNA链以稳定的速度通过镶嵌在电阻膜的蛋白纳米孔时,不同碱基引发电流波动产生特征性改变,进而被特异性识别,用以确定DNA/RNA的碱基序列。
测序原理图
应用方向
技术优势
● 长度长
Reads可达Mb,能够完美跨越高重复区域和高复杂区域,便于分析。
● 直接测序
直接测序原始DNA和RNA,不需要进行PCR扩增,避免了扩增偏好性;保留了原始碱基修饰信息。
● 实时
快速知晓样本状态,完成种属鉴定。
上海柏辰已发表部分文章展示
耐药突变测序
Zhao K, Tu C, Chen W, Liang H, Zhang W, Wang Y, Jin Y, Hu J, Sun Y, Xu J, Yu Y. Rapid Identification of Drug-Resistant Tuberculosis Genes Using Direct PCR Amplification and Oxford Nanopore Technology Sequencing [J]. Can J Infect Dis Med Microbiol, 2022, 2022:7588033.
◆ 突变检出与一代测序相比完全一致,涵盖更多区域。
◆ 与传统药敏试验相比,提前3-4周可获知患者耐药情况。