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想要扩增曲线稳定又漂亮?跟着这份qPCR实验操作 × CFX Opus 96上机攻略做!

来源: | 作者:/ | 发布时间: 2026-06-05 | 22 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:

实时荧光定量PCR

—— 完整实验操作+上机流程


要说实验室里既让人离不开、又时不时捏把汗的实验,实时荧光定量PCR(qPCR)绝对算一个。它灵敏、精准,是基因表达分析和病原检测的“金标准”,可一旦遇上加样手抖、程序设错或者上机操作卡壳,再珍贵的样本也难免打水漂。

为了告别qPCR焦虑,这一次我们以Bio-Rad CFX Opus 96荧光定量PCR仪为例,从实验前的准备、反应体系配制,到上机程序设置与结果分析,一步步拆解完整操作流程。全程干货,建议先收藏,再跟着操作,让你的扩增曲线从此稳定又漂亮!


实验清单

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实验前准备

1

试剂准备

a. SsoAdvanced Universal SYBR Green Supermix(货号:1725270):-20℃避光长期保存,4℃可存放≤3个月。

b. 上下游引物、cDNA/基因组DNA模板、无核酸酶水。

2

仪器与耗材准备

a. 96孔qPCR板:Hard-Shell 96-Well PCR Plates(HSP9601)

b. 光学封膜:Microseal 'B' PCR Plate Sealing Film(MSB1001)

c. 避光冰盒

d. 离心机

e. 校准移液器

f.  定量PCR仪:CFX Opus 96

3

模板用量范围

a. cDNA:100 ng - 100 fg / 反应

b. 基因组DNA:50 ng - 5 pg / 反应


反应体系配制(20 µL 标准体系)

1

体系组成

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体系配制步骤

a. 试剂冰上融化,充分颠倒混匀,短暂离心,全程冰上避光操作

b. 根据实验需求,进行体系的配制。

c. 将反应体系分装至qPCR板各孔。

d. 贴光学封膜,涡旋混匀≥30秒,离心去气泡,使液体沉底。

3

试剂配制关键注意事项

a. 全程避光:SYBR Green染料光敏,操作与放置必须避光。

b. 避免反复冻融:建议分装使用,减少冻融次数。

c. 冰上快速操作:试剂含热启动酶,室温放置过久影响特异性。

d. 充分混匀:Supermix使用前必须颠倒混匀,禁止剧烈震荡。

e. 先配Mix,后加模板:降低引物二聚体与非特异性扩增。

f.  必须设置 NTC 无模板对照:排除体系污染。

g. 体积精准:使用校准移液器,保证体系均一性。

h. 必须去气泡:离心去除气泡,避免荧光信号干扰。


CFX Opus 96 上机操作流程

1

开机运行

打开电脑➡打开定量PCR仪电源开关➡启动 CFX Maestro软件

2

放置样品

a. 单击 CFX Maestro 软件左下角 Open Lid(打开热盖),将96孔板放入仪器的加热孔中。

b. 样品放置妥当后,单击 CFX Maestro 软件左下角 Close Lid(关闭热盖)。

3

设置程序

CFX Maestro 软件操作基本步骤如下:

a. 设置热循环程序文件(Protocol Tab)

点击Edit(编辑)或 Create New(创建新程序),根据 Supermix 进行相关参数设定。

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图1 cDNA参数设定

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图2 gDNA参数设定(注:建议使用98℃处理基因组DNA模板,以确保完全变性)

较短的退火/延伸时间(1-10s)适用于扩增产物长度小于100bp的情况。较长的退火/延伸时间(40-60s)则适用于扩增产物长度大于250bp、富含GC或AT序列的目标、粗制样本或需要较高输入量(例如 100ng cDNA 或 50ng 基因组DNA)的情况。

b. 设置样品板文件(Plate Tab)

根据本次实验的荧光染料种类,选择相应预设好的快速样品板设置文件,染料法选择 Quick Plate_96 wells_SYBR Only.pltd;探针法选择Quick Plate_96 wells_All Channels.pltd。

然后单击 Edit Selected(编辑选择文件)或 Create New(创建新文件)进行样品信息的编辑。

c. 运行实验(Start Run Tab)

单击 Start Run,根据提示保存文件,开始运行程序。


结果分析


1. 运行完成后停止程序,取出qPCR板。

2. 数据分析要点:

  • 扩增曲线:S型光滑、起峰正常、复孔一致性好。

  • 熔解曲线:单峰,无引物二聚体或非特异峰。

  • 读取Cq值,进行标准曲线或相对定量计算。

3. 保存实验文件,导出数据与图谱。

核心总结

1. 试剂配制:冰上、避光、快速、充分混匀、先 Mix 后模板。

2. 上机程序:严格按说明书设置,60℃退火延伸,必做熔解曲线。

3. 质量控制:必须设置 NTC,保证无气泡、无反复冻融。

看到这里,整套qPCR实验操作和CFX Opus 96的上机流程,相信你已经心中有数了。如果你在实验中还遇到过棘手问题,欢迎在评论区告诉我们。愿大家的qPCR都顺顺利利,曲线一跑就起飞~