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实时荧光定量PCR
—— 完整实验操作+上机流程
要说实验室里既让人离不开、又时不时捏把汗的实验,实时荧光定量PCR(qPCR)绝对算一个。它灵敏、精准,是基因表达分析和病原检测的“金标准”,可一旦遇上加样手抖、程序设错或者上机操作卡壳,再珍贵的样本也难免打水漂。
为了告别qPCR焦虑,这一次我们以Bio-Rad CFX Opus 96荧光定量PCR仪为例,从实验前的准备、反应体系配制,到上机程序设置与结果分析,一步步拆解完整操作流程。全程干货,建议先收藏,再跟着操作,让你的扩增曲线从此稳定又漂亮!
实验清单


实验前准备
试剂准备
a. SsoAdvanced Universal SYBR Green Supermix(货号:1725270):-20℃避光长期保存,4℃可存放≤3个月。
b. 上下游引物、cDNA/基因组DNA模板、无核酸酶水。
仪器与耗材准备
a. 96孔qPCR板:Hard-Shell 96-Well PCR Plates(HSP9601)
b. 光学封膜:Microseal 'B' PCR Plate Sealing Film(MSB1001)
c. 避光冰盒
d. 离心机
e. 校准移液器
f. 定量PCR仪:CFX Opus 96
模板用量范围
a. cDNA:100 ng - 100 fg / 反应
b. 基因组DNA:50 ng - 5 pg / 反应
反应体系配制(20 µL 标准体系)
体系组成

体系配制步骤
a. 试剂冰上融化,充分颠倒混匀,短暂离心,全程冰上避光操作。
b. 根据实验需求,进行体系的配制。
c. 将反应体系分装至qPCR板各孔。
d. 贴光学封膜,涡旋混匀≥30秒,离心去气泡,使液体沉底。
试剂配制关键注意事项
a. 全程避光:SYBR Green染料光敏,操作与放置必须避光。
b. 避免反复冻融:建议分装使用,减少冻融次数。
c. 冰上快速操作:试剂含热启动酶,室温放置过久影响特异性。
d. 充分混匀:Supermix使用前必须颠倒混匀,禁止剧烈震荡。
e. 先配Mix,后加模板:降低引物二聚体与非特异性扩增。
f. 必须设置 NTC 无模板对照:排除体系污染。
g. 体积精准:使用校准移液器,保证体系均一性。
h. 必须去气泡:离心去除气泡,避免荧光信号干扰。
CFX Opus 96 上机操作流程
开机运行
打开电脑➡打开定量PCR仪电源开关➡启动 CFX Maestro软件
放置样品
a. 单击 CFX Maestro 软件左下角 Open Lid(打开热盖),将96孔板放入仪器的加热孔中。
b. 样品放置妥当后,单击 CFX Maestro 软件左下角 Close Lid(关闭热盖)。
设置程序
CFX Maestro 软件操作基本步骤如下:
a. 设置热循环程序文件(Protocol Tab)
点击Edit(编辑)或 Create New(创建新程序),根据 Supermix 进行相关参数设定。

图1 cDNA参数设定

图2 gDNA参数设定(注:建议使用98℃处理基因组DNA模板,以确保完全变性)
较短的退火/延伸时间(1-10s)适用于扩增产物长度小于100bp的情况。较长的退火/延伸时间(40-60s)则适用于扩增产物长度大于250bp、富含GC或AT序列的目标、粗制样本或需要较高输入量(例如 100ng cDNA 或 50ng 基因组DNA)的情况。
b. 设置样品板文件(Plate Tab)
根据本次实验的荧光染料种类,选择相应预设好的快速样品板设置文件,染料法选择 Quick Plate_96 wells_SYBR Only.pltd;探针法选择Quick Plate_96 wells_All Channels.pltd。
然后单击 Edit Selected(编辑选择文件)或 Create New(创建新文件)进行样品信息的编辑。
c. 运行实验(Start Run Tab)
单击 Start Run,根据提示保存文件,开始运行程序。
结果分析
1. 运行完成后停止程序,取出qPCR板。
2. 数据分析要点:
扩增曲线:S型光滑、起峰正常、复孔一致性好。
熔解曲线:单峰,无引物二聚体或非特异峰。
读取Cq值,进行标准曲线或相对定量计算。
3. 保存实验文件,导出数据与图谱。
核心总结
1. 试剂配制:冰上、避光、快速、充分混匀、先 Mix 后模板。
2. 上机程序:严格按说明书设置,60℃退火延伸,必做熔解曲线。
3. 质量控制:必须设置 NTC,保证无气泡、无反复冻融。
看到这里,整套qPCR实验操作和CFX Opus 96的上机流程,相信你已经心中有数了。如果你在实验中还遇到过棘手问题,欢迎在评论区告诉我们。愿大家的qPCR都顺顺利利,曲线一跑就起飞~
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